При этом наиболее сильно загрязнены днища рек Киевка, Брынь, Цыганка, Яченка. Наименее загрязненными являются Болва, Мышега и Шаня. Детально состояние дна крупнейших рек региона представлены на диаграмме.
Загрязнение дна рек связано антропогенным влиянием посредством сброса сточных вод и смыва с прилегающих территорий. Также данное явление связано с активными природными процессами, происходящими в водотоках, такими как разложение флоры и фауны и дальнейшее включение продуктов разложения в круговорот веществ водной экосистемы. Ярким проявлением влияния природы является повышенное содержание железа во всех пробах донных отложений. Обуславливается это значительной концентрацией железа в почве региона.
Ряд рек характеризуются рукотворной захламленностью русел, что увеличивает риски подтопления в период ледостава, дождей и прочих случаев высокого объема стока. Наиболее критичны завалы мусора на входе в водоводы, предназначенные для проводки водотоков под мостами. В таких случаях перелив воды поверх водоводов может приводить к подмыванию опор моста, создавая угрозу его разрушения. Наиболее неблагополучными в плане захламления русел являются реки Киевка, Терепец, Яченка и Городенка.